STIS Al Wafa didirikan oleh Yayasan Al Fityan, Yayasan Al Fityan adalah sebuah organisasi masyarakat yang bergerak di bidang pendidikan berkontribusi untuk meningkatkan kualitas dan kompetensi generasi bangsa melalui pendidikan dari PAUD hingga Perguruan Tinggi.
(STIS) Al Wafa memiliki narasi besar mencetak generasi unggul, terdepan, profesional, berakhlak mulia dan memiliki pemahaman keislaman yang moderat.
STIS Al Wafa mengkonsep struktur kurikullum, kegiatan perkuliahan dan kegiatan penunjang lainnya berlandaskan kepada pedoman, aturan yang diterbitkan oleh pemerintah dan dengan memadukan program tambahan dari internal Yayasan.
Program perkuliahan ini ditempuh selama 4 tahun dengan rincian :
Pada 2 tahun pertama tinggal di asrama dan gratis makan 3 kali sehari di kantin kampus. Pada tahun ke- 3 asrama tetap gratis bagi yang mau namun makan berbayar. Pada tahun ke-4 mengabdi/praktek mengajar di pesantren atau sekolah di Indonesia atau luar negeri sambil menulis skripsi.
